以依赖肽序列的方式,一个NAC域转录因子基因,拟南芥ANAC096的番茄类似物的一个上游开放阅读框抑制表达
Published: 2016-02-01
Keyword: Macrocyclic peptides,多肽修饰,抗菌肽
关键词: 上游开放阅读框,翻译调控,初期肽
出版时间:2015-07 Plant Biotechnology ,10.5511/plantbiotechnology.15.0519a
在它们的5′非翻译区(5′-UTRs),许多真核mRNAs含有一个或多个上游开放阅读框(uORFs)。一些上游开放阅读框编码抑制主要开放阅读框(ORP)翻译的调控多肽。为了全面鉴定上游开放阅读框编码调控多肽,通过生物信息学的手段,全基因组搜索含有演化保守氨基酸序列上的上游开放阅读框,称之为保守肽上游开放阅读框(CPuORFs)。
因此,该文研究了番茄ANAC096类似物的保守肽上游开放阅读框序列对主要开放阅读框表达的影响,因为与ANAC096相比,其是高度保守型氨基酸序列,突变分析表明以依赖肽序列的方式,番茄ANAC096类似物的保守肽上游开放阅读框抑制主要开放阅读框的表达,并且还表明保守肽上游开放阅读框序列的关键氨基酸残基与抑制表达有关。
该研究表明一个新型的依赖肽序列调控上游开放阅读框和上游开放阅读框肽调控表达水平在密切相关的类似物之间有所区别。
Alignment of the CPuORF sequences of the ANAC096 homologues. Amino acid sequence alignment of the ANAC096 homology group CPuORFs (upper) and nucleotide sequence alignment of the highly conserved region of the CPuORFs (lower) are indicated above.
ANAC096类似物保守肽的上游开放阅读框的队列。上图显示ANAC096类似物组保守肽上游开放阅读框(上)的氨基酸序列队列和高度保守的上游开放阅读框(下)的核苷酸序列。