FITC修饰过程中为什么插入linker
Published: 2016-08-10
Keyword: FITC,Linker,Edman降解,6-氨基己酸
FITC(异硫氰酸荧光素酯)是多肽,抗体蛋白常用的荧光标记物,一般修饰在多肽的N端或者序列中赖氨酸的侧链上,在我们固相合成过的FITC修饰肽中,只要出现在序列N端的,我们在修饰FITC之前都会插入一个linker,而在序列赖氨酸侧链修饰的时候,往往都不需要插入linker,下面我们介绍下这其中的原因。
Edman 降解(Edman degradation),从多肽链游离的N末端测定氨基酸残基的序列的过程。N末端氨基酸残基被异硫氰酸苯酯修饰,然后从多肽链上切下修饰的残基,再经层析鉴定,余下的多肽链(少了一个残基)被回收再进行下一轮降解循环。
所以如果FITC直接修饰在N端氨基的时候,在切割过程中时候发生Edman degradation反应,如下图。
为了避免这个副反应的发生,我们在N端标记的时候一定要加一个linke,如2-氨基乙酸,3-氨基丙酸,6-氨基己酸,目前我们常用的是6-氨基己酸,应为较长的碳链可以降低对活性中心的影响,同时又能很好的与FITC反应。所以赖氨酸侧链修饰FITC,我们可以不用加linker。
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